Jeronimus Cornelisz wordt in Leeuwarden geboren in 1598. Hij groeit op in een niet-alledaags gezin; zijn ouders horen mogelijk tot een militante religieuze sekte. Als jongeling doorloopt hij waarschijnlijk de Latijnse school in Dokkum en volgt daarna een opleiding tot apotheker. Vijf jaar lang drijft hij een apothekerswinkel in zijn geboortestad. Na problemen met het gemeentebestuur verhuist hij naar Haarlem waar hij een nieuwe zaak opzet. Als die failliet gaat, waarschijnlijk door familieproblemen en geldzorgen, meldt hij zich aan bij de VOC. Hij wordt aangenomen als onderkoopman op de Batavia.